第一道館
【１】遊戲開始走出家門後，直接往北方草叢走，此時、皮卡丘會跑出來，博士幫你抓住牠、並把你帶回研究所。
【２】去研究所後要走出時，小茂會攔住你、並和他的神奇寶貝《依布ＬＶ．５》對打。
【３】打贏之後，走出研究所再往北方走到村莊內，到ＳＨＯＰ去，店裡的老闆會給你一樣東西。
【４】之後你要回到研究所，博士便會把神奇寶貝圖鑑交給你。
【５】走到研究所北方的建築物中跟屋內的女子《小茂的姊姊》談話，即可得到地圖。
【６】再回到北方村莊《ｐ．ｓ． 城左下角有一個被細樹圍住的男子，等學到砍樹技能之後，把樹砍掉和他說話，可得到招式機４２，向西邊的２２號道路走，就會遇到小茂，和他的神奇寶貝交戰。
【７】向北走經過常磐森林內有許多昆蟲類的神奇寶貝，到達另一村莊。《ｐ．ｓ．右方道路在怪獸學到砍樹後才能去、和建築物中的一人說話，便會給你秘傳機０５《條件：神奇寶貝要１０隻以上》。
【８】過了森林後來到有第一個ＧＹＭ《小剛》的城市，得勝後可得到招式機３４。《ｐ．ｓ．用巴大蝴ＬＶ．１０或猴怪ＬＶ．９時學到的技能對抗道館較有用》。
第二道館
【９】繼續向東走，一路上有許多敵人要注意！
【１０】到達ＰＯＫＥ、有個人在賣ＮＯ．１２９鯉魚王，請不要買！因為以後可以用釣竿去釣《買會浪費５００＄》。
【１１】進入東邊的月見山洞窟、請多準備回復道具！到月見山時，會有很多稀少的神奇寶貝，如：皮皮、派拉斯、超音蝠、小拳石．．．等。進入之後往左側走，拿到密寶再往右側走，每一個瞬間移動器都要去，從山洞往上再往右往上往左往下往左再往上，踩瞬入間移動器，走樓梯往右側，順著路走，最後遇到一人，跟他打贏了後，順路走即可。洞窟底端有一處要二選一，有兩個化石可選《右者為：菊石獸／左者為：化石盔》。然後和火箭隊打一場，打贏才能走！
【１２】出了洞窟，再向東走，到達村莊。《注意：中途有招式機０４，要記得拿取！》
【１３】先提昇等級去挑戰第二個ＧＹＭ《小霞》勝利後、可得招式機１１。《ｐ．ｓ．在ＰＯＫＥ旁的一間房子裡，有一女人，如果你和皮卡丘的感情很好，她會給你妙蛙種子《打完道館馬上去拿》。
【１４】往北方２４號道路走去，則會遇到競爭對手小茂，打贏後繼續走、一路上有許多敵人《ｐ．ｓ．在道路最上方有一人和他說話可得到小火龍》。
第三道館
【１５】到實驗室以後，見到一隻神奇寶貝跟牠談話，牠會走進神奇寶貝轉換機器、再到電腦前調查，他會變成人類跟他講話可得到船票。
【１６】回到村莊，通過原本有警察擋住的屋子，打倒屋子後面的黑衣人。
【１７】向南邊走進一間小屋，通過屋內的地下道。《ｐ．ｓ．在入口處有一個人可以和你換神奇寶貝》。
【１８】出了屋子向南走即可到達漁村，漁村中有一間屋子住著一個人會給你爛釣竿《只能釣到鯉魚王》。
【１９】還有一間屋子《有個大圓桌》，屋主會給你交換卷，可拿到前個村莊《小霞道館》去換腳踏車。
【２０】向東走有個洞窟裡面住著神奇寶貝ＮＯ．５０地鼠。經過洞窟出來後有間房子可以換到ＮＯ．１２２吸盤魔偶。
【２１】到港口去上船，並打倒乘客的神奇寶貝，往船長室走去時會遇到競爭對手《小茂》打贏後再跟船長見面船長會給你秘傳機０１《砍樹》，拿到砍樹以後就可以到此村的ＧＹＭ去。調查那些桶子會有反應《最右上方的桶子》，需連續兩次調查到正確的《先調查一個，如果對了另一個就在下面》，頭目的門才會打開。建議使用屬性為地面的怪獸《如：小火龍、地鼠》。請注意《打完即可去和站在此城鎮中央的女警談話，可得到傑尼龜》。
第四道館
【２２】回到有腳踏車店的村莊，將東邊的樹砍倒、向東行，到達最東邊有一家ＰＯＫＥ旁邊是黑暗洞窟。而下方的無人發電廠等學會了游泳再去裡面就會有雷電鳥。
【２３】通過黑暗洞窟《用秘傳機05閃光》，向南行即可到達一村莊，此村莊有一棟很大建築物是神奇寶貝塔，先別進去！向西走到一間有地道的屋子穿越後，可到達一座大城市。
【２４】此處有一間百貨公司《４樓有火、雷、水之石可買》，也可以購買到許多重要道具。到樓頂去買飲料！三種都買、跟頂樓的人講話會給你招式機１３／招式機４８／招式機４９，至於要通過東邊買最便宜的就可以了。注意一下有一棟公寓，這棟屋子有後門！走到後門進去可拿到ＮＯ．１３３伊布。
【２５】到遊樂場去跟正在看牆上東西的黑衣人交談，解決他後、調查牆上東西，右方會出現樓梯。
【２６】跟此城鎮中的餐館(遊樂場下第二間)裡坐在牆角的人交談，可得可存代幣的東西，9999個可換到3D龍。
【２７】到遊樂場裡右方樓梯下去，清除掉各樓層的黑衣人。注意Ｂ４有個站在桌子旁的黑衣人，打倒他可得他身旁的電梯鑰匙。坐電梯到Ｂ４去打倒頭目，可拿到《神奇寶貝透視鏡》。再坐到Ｂ１，打倒黑衣人門會打開。
【２８】到此城最下方的ＧＹＭ去吧！有很多植物系的敵人。
第五道館
【２９】回神奇寶貝塔去，往樓上爬、清除各樓層的敵人，競爭對手也會出現。五樓有個可讓神奇寶貝回復的地方，到樓頂跟一老人交談後回到他家中《上樓之前遇到的嘎拉嘎拉，是抓不到的》會給你神奇寶貝之笛，可喚醒沉睡的ＮＯ．１４３卡比獸《只有兩隻。用２００元的寶貝球收服即可》。而且神奇寶貝之笛也可以在神奇寶貝被催眠時使用，可喚醒他們。
【３０】再回到百貨公司去拿飲料給守衛喝，就會放你通行。可以進入一家大城市。以後都可以來去無阻了。
【３１】北邊兩個ＧＹＭ，左邊的沒人擋住，可以先打發掉。戰勝後頭目後方有兩個神奇寶貝《ＭＯ．１０６沙瓦郎和ＮＯ．１０７艾比郎》只能二選一。到此城中最大的建築物去，一路往上打有許多門需要用鑰匙打開，鑰匙就在５Ｆ一條極狹窄的通道中，敵人都相當的強，競爭對手也會出現，手持好幾隻ＬＶ．３７以上的怪物，注意穿山王不可用皮卡丘去打！打完競爭對手時旁邊有個人和他說話可得到乘龍。經過他身後的傳送點才能上到最頂層，跟ＢＯＳＳ交戰後，城中的黑衣人都會消失。跟坐在沙發上的人交談，可得天王球。
第六道館
【３２】順便把剩下的ＧＹＭ給解決掉吧！多帶些格鬥類型的打起來較輕鬆。
【３３】打完了回到漁村東邊的道路上，有隻神奇寶貝《ＮＯ．１４３卡比獸》擋住了去路，在牠身旁使用神奇寶貝塔中救出的老人給的道具《神奇寶貝之笛》，牠就會醒，抓起來或打倒他即可通過。
【３４】接著通過道路１６《上方有一房子中有人會給你秘傳機０２》，１７號道路。此處需使用自行車來行動，一路上有許多暴走族，幾乎都是使用毒類型的神奇寶貝。
第七道館
【３５】到了下一個城市。此處的ＧＹＭ請使用超能力類型的即可輕鬆解決。到位於東南方的建築物，會遇到狩獵區的管理者，他遺失了假牙，請你幫他找。到北邊的狩獵區去，五百元即可進入，仔細的把金色假牙和秘傳機０３找出來，再把假牙拿去換秘傳機０４，然後即可讓神奇寶貝學習到推動大石《讓怪獸學習後，使用方法與砍樹用法相同，使用後會聽到怪獸的叫聲，然後只要在大石頭前按下方向鍵即可》和游泳《站在水邊即可使用》的技巧了！
【３６】以游泳的技巧游過１９號水道，到達雙子島進入島上洞窟，以你的智慧將大石推來推去解謎吧！此洞中有傳說中的ＮＯ．１４４急凍鳥可抓《神奇寶貝球２００元即可補捉到》。
【３７】通過此洞後再游過２０號水道，會來到一個城鎮。此處有一間神奇寶貝研究所，將你身上擁有的化石交給某位研究員，過一段時間再回來拿即可復活喔！
第八道館
【３８】前往荒廢神奇寶貝屋後，主要的目的是為獲取進入此鎮ＧＹＭ的鑰匙。重點是有很多的怪獸雕像，調查即可扳動機關打開通道！
【３９】在荒廢神奇寶貝屋內獲得鑰匙以後就可以去解決ＧＹＭ中的道館家了。他主要是用火屬性的神奇寶貝，只要帶幾隻水屬性的就可以把握打剩仗了。
【４０】剩下一個ＧＹＭ了，游過２１號水道回到了真新鎮，再向北到常磐市後，去把原本無法進入的ＧＹＭ解決掉吧！《建議使用超能力和水屬性的較容易》，打完後向西轉入２２號道路，此時又會遇到討厭的競爭對手，把他解決掉，再往２３號道路入口前進。
冠軍聯盟
【４１】在往北走的路途中，會有許多守衛檢查你的徽章，一一通過後，到達最後一個洞窟，這裡又有許多討厭的大石頭，接下來就要靠玩家自行解開這些路況囉！此處的挑戰者們都相當強，不過只要帶著水、冰、超能力的神奇寶貝應該就沒問題！還有，這裡有傳說中的ＮＯ．１４６火燄鳥可以捕捉唷！
【４２】通過以後，來到最終決戰場所了！在前面等著你的是超強的四大天王和已經蛻變的競爭對手小茂。需注意的事情是一旦進入以後就無法出來恢復體力，只能靠你的道具來救自己了。所以要記得先將狀態調整好，還有別忘了打完每個天王後都要檢查一下體力夠不夠。
【４３】打贏最後四天王和小茂，你就是贏家了！全破之後，別忘了去挑戰花藍市左邊的花藍洞窟內有超夢，可用天王球抓！《２００元寶貝球也可》。